Accession
MI0036961
Description
Picea abies
pab-MIR11501 precursor miRNA
Sequence
agaauaagucagcgagagaugagUAUUGGAAAGGCGAGUUGGCUuugcaagacguaaagcgaaccaaaaaaugauucaguucuucuggacaaagugauaauauggauaauaacaagaauguucaaugggaacaguguugcuguuauccauuuuaucauucuuguaaguccaugagaucacugucaugagccaaagugaauccuuuuuuugguuagcuuugcgucuaacaaaucccacucgucauuccaauacuuaccucucccugaauuauucu
(((((((.((((.(((((.((((((((((((.(((((((.((.((((..(((((((((((.((((((((((.((((((.((.(((..((((..(((((..(((((((....(((((((((...((((((((((((...)))))).))))))....)))))))))..)))))))..)))))))))..)))...)).))))))..)))))))))).)))))))))))..)))).)).))))))).)))))))))))).))))).)))).)))))))
(((((((.((((.(((((.((((((((((((.(((((((.((.((((..(((((((((((.((((((((((.((((((.((.(((..((((..(((((..(((((((....(((((((((...((((((((((((...)))))).))))))....)))))))))..)))))))..)))))))))..)))...)).))))))..)))))))))).)))))))))))..)))).)).))))))).)))))))))))).))))).)))).)))))))
Structure
g c a A U C ca g -u g --c ug aa aa aaua -uuc - g
agaauaa ucag gagag ugagUAUUGGAA GGCGAGU GG Uuug agacguaaagc aaccaaaaaa gauuca uu uuc gaca gugau uauggau acaagaaug aauggg aacagu
||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||| |||||||||| |||||| || ||| |||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||| u
ucuuauu aguc cucuc auucauaaccuu cugcuca cc aaac ucugcguuucg uugguuuuuu cuaagu aa gag cugu cacua guaccug uguucuuac uuaccu uugucg
a c c a c u aa a uc g acc ua -- ga --aa uauu a u
Annotation confidence
Not enough data
Do you think this miRNA is real?
Genome context
MA_836587: 1194-1467 [-]
Database links
Mature pab-miR11501
| Accession | MIMAT0045059 |
| Description | Picea abies pab-miR11501 mature miRNA |
| Sequence | 24 - UAUUGGAAAGGCGAGUUGGCU - 44 |
| Evidence |
experimental
Illumina [1] |
References
|
