Accession
MI0035649
Description
Malus domestica
mdm-MIR11002c precursor miRNA
Sequence
caacaaccuacuccaaccaccCCCAGUCACCUCCGAAGCUCAuccucacgcaaaguuccuuuucuuuuucuaucucucuccucgagauccuucucucuugaauucuugcacuagaucgugauccauucauccaucuagucaaacaacaaauguuuuguggaguuggaaauuugagaauggaagauauagugaggaauucgauagagaaagaucucgaggagagagagaaggaacuuugcggucgguGAGGAUGAGCUUCGGCGGUGAcuggggugguuggaaucuuucuua
...........((((((((((((.(((((((.((((((((((((((((((((((((((((((..........(((((((((((((((((.((((((.((((((((((.(((((.(((....(((((((.((((((((...(((((.....)))))..))))..)))).......))))))).))).))))))))))))))).)))))).)))))))))))))))))))))))))))))).....))))))))))))))))).)))))))))))))))))))..........
...........((((((((((((.(((((((.((((((((((((((((((((((((((((((..........(((((((((((((((((.((((((.((((((((((.(((((.(((....(((((((.((((((((...(((((.....)))))..))))..)))).......))))))).))).))))))))))))))).)))))).)))))))))))))))))))))))))))))).....))))))))))))))))).)))))))))))))))))))..........
Structure
caacaaccuac C U ----- ucuuuuucua c c g g guga ------a -- guc a
uccaaccaccCC AGUCACC CCGAAGCUCAuccucac gcaaaguuccuuu ucucucuccucgagauc uucucu uugaauucuu cacua auc uccauuc ucca ucua aaaca c
|||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||| |||| |||| ||||| a
agguuggugggg ucAGUGG GGCUUCGAGUAGGAGug cguuucaaggaag agagagaggagcucuag aagaga agcuuaagga gugau uag agguaag aggu aggu uuugu a
-auucuuucua - C gcugg ---------- a u - a ---a aguuuaa ug -gu a
Annotation confidence
Low
Do you think this miRNA is real?
Genome context
MDC010482.578: 8757-9047 [-]
Database links
Mature mdm-miR11002c-5p
| Accession | MIMAT0043596 |
| Description | Malus domestica mdm-miR11002c-5p mature miRNA |
| Sequence | 22 - CCCAGUCACCUCCGAAGCUCA - 42 |
| Evidence |
experimental
Illumina [1] |
Mature mdm-miR11002c-3p
| Accession | MIMAT0043597 |
| Description | Malus domestica mdm-miR11002c-3p mature miRNA |
| Sequence | 247 - GAGGAUGAGCUUCGGCGGUGA - 267 |
| Evidence |
experimental
Illumina [1] |
References
|
