miRBase entry: 20229201

Novel microRNAs in silkworm (Bombyx mori)

PubMed ID 20229201
Authors "Cai Y, Yu X, Zhou Q, Yu C, Hu H, Liu J, Lin H, Yang J, Zhang B, Cui P, Hu S, Yu J"
Journal "Funct Integr Genomics
Volume 10
Pages 405-415

There are 259 miRNAs associated with this paper:
Name Accession RPM Chromosome Start End Strand Confidence
bmo-mir-2739 MI0012188 29 NW_004582029.1 1198265 1198362 + -
bmo-mir-2745 MI0012196 1200 NW_004582030.1 2421486 2421564 - -
bmo-mir-306a MI0012201 55075 NW_004581774.1 30978 31085 + High
bmo-mir-316 MI0012292 10 NW_004582031.1 2958961 2959042 + -
bmo-mir-33 MI0012293 192 NW_004582008.1 9552124 9552203 + High
bmo-mir-11 MI0012294 1093 NW_004581691.1 1165065 1165140 + -
bmo-mir-308 MI0012296 9242 NW_004582010.1 8094179 8094254 - High
bmo-mir-279d MI0012297 110 NW_004582019.1 739120 739195 + -
bmo-mir-1175 MI0012300 446 NW_004581697.1 1535938 1536019 - High
bmo-mir-2755 MI0012302 5326 NW_004581693.1 228097 228175 - High
bmo-mir-2733e-2 MI0012303 4 NW_004581684.1 342566 342664 - -
bmo-mir-2733c MI0012306 9 NW_004581684.1 353724 353805 - -
bmo-mir-2756 MI0012309 3345 NW_004581715.1 1320630 1320706 - High
bmo-mir-2757 MI0012311 100 NW_004582009.1 1928109 1928186 - High
bmo-mir-2758 MI0012312 2294 NW_004582035.1 2816104 2816179 + High
bmo-mir-2763 MI0012317 4 NW_004581731.1 1485728 1485812 + -
bmo-mir-2764 MI0012318 9 NW_004581782.1 662619 662699 - -
bmo-mir-2765 MI0012319 15 NW_004582019.1 1827507 1827581 + -
bmo-mir-750 MI0012322 99 NW_004581697.1 1536089 1536167 - -
bmo-mir-2768 MI0012323 66 NW_004582034.1 4213060 4213156 - -
bmo-mir-375 MI0012324 3683 NW_004581700.1 2059423 2059501 + High
bmo-mir-2778d MI0012349 290 NW_004617724.1 662 737 + High
bmo-mir-2778b MI0012351 503 NW_004607897.1 218 294 - High
bmo-mir-2797a MI0012370 3 NW_004581747.1 1275167 1275243 - -
bmo-mir-2797c MI0012372 9 NW_004581747.1 1275549 1275624 - -
bmo-mir-2797d MI0012373 8 NW_004581747.1 1275750 1275840 - -
bmo-mir-1000 MI0013533 0 NW_004581752.1 862500 862581 + -
bmo-mir-2998 MI0013854 159 NW_004581712.1 4762 4856 + -
bmo-mir-2733f MI0013856 1 NW_004581684.1 346080 346197 - -
bmo-mir-2733g MI0013857 1 NW_004581684.1 347847 347958 - -
bmo-mir-3000 MI0013860 48 NW_004581745.1 994719 994839 - -
bmo-mir-3203 MI0014255 1 NW_004582016.1 7181887 7181986 + -
bmo-mir-3204a MI0014256 7 NW_004582015.1 5517228 5517334 + -
bmo-mir-3205 MI0014257 None NW_004582018.1 4041725 4041838 - -
bmo-mir-3206 MI0014258 None NW_004582018.1 6922628 6922725 - -
bmo-mir-3207 MI0014259 0 NW_004582017.1 4934850 4934960 - -
bmo-mir-2808d MI0014260 68 NW_004582028.1 418407 418538 - -
bmo-mir-3208 MI0014261 3 NW_004582028.1 3499267 3499362 - -
bmo-mir-3209 MI0014262 None NW_004582028.1 4137723 4137844 + -
bmo-mir-3210 MI0014263 None NW_004581723.1 1635731 1635844 + -
bmo-mir-3211 MI0014264 None NW_004581824.1 88924 89051 + -
bmo-mir-3212 MI0014265 0 NW_004581833.1 57508 57642 - -
bmo-mir-3213 MI0014266 1 NW_004582459.1 2521 2643 + -
bmo-mir-3214 MI0014267 0 NW_004581704.1 1392914 1393047 - -
bmo-mir-3215 MI0014268 0 NW_004581738.1 1451931 1452051 - -
bmo-mir-3216 MI0014269 0 NW_004581751.1 552448 552565 + -
bmo-mir-3217 MI0014270 0 NW_004582010.1 3054987 3055135 - -
bmo-mir-3218 MI0014271 0 NW_004582010.1 5146933 5147056 + -
bmo-mir-3219 MI0014272 13 NW_004582010.1 5219180 5219310 + -
bmo-mir-3220 MI0014273 0 NW_004582008.1 856111 856189 + -
bmo-mir-3221 MI0014274 None NW_004581690.1 2360751 2360855 - -
bmo-mir-3222 MI0014275 None NW_004582009.1 1169827 1169953 + -
bmo-mir-3223 MI0014276 None NW_004582459.1 2677 2778 + -
bmo-mir-3224 MI0014277 0 NW_004581720.1 78936 79067 - -
bmo-mir-279e MI0014278 None NW_004582009.1 6127664 6127769 - -
bmo-mir-3225 MI0014279 None NW_004582009.1 6971249 6971387 + -
bmo-mir-3226 MI0014280 None NW_004582009.1 8155296 8155418 - -
bmo-mir-3227 MI0014281 0 NW_004582009.1 10373555 10373691 - -
bmo-mir-3228 MI0014282 1 NW_004581785.1 199374 199485 + -
bmo-mir-3229 MI0014283 7 NW_004581785.1 203938 204075 + -
bmo-mir-3230 MI0014284 0 NW_004581785.1 256874 257003 - -
bmo-mir-3231 MI0014285 None NW_004581781.1 176567 176676 + -
bmo-mir-3232 MI0014286 7 NW_004581739.1 206010 206143 - -
bmo-mir-3233 MI0014287 None NW_004581764.1 277109 277220 + -
bmo-mir-3234 MI0014288 None NW_004582163.1 24148 24276 + -
bmo-mir-2808e MI0014289 51 NW_004581762.1 604257 604365 + -
bmo-mir-3235 MI0014290 18 NW_004581762.1 851545 851634 + -
bmo-mir-3236 MI0014291 None NW_004582024.1 4266773 4266896 + -
bmo-mir-3237 MI0014292 0 NW_004582024.1 5007199 5007305 + -
bmo-mir-3238 MI0014293 42 NW_004581712.1 3566 3680 + Low
bmo-mir-3239 MI0014294 1 NW_004581862.1 4535 4630 + -
bmo-mir-3241 MI0014296 None NW_004582008.1 4901844 4901964 + -
bmo-mir-3242 MI0014297 2 NW_004581687.1 2446453 2446597 - -
bmo-mir-3243 MI0014298 8 NW_004581687.1 2846647 2846789 - -
bmo-mir-3244 MI0014299 87 NW_004581689.1 26005 26126 - -
bmo-mir-3245 MI0014300 1 NW_004581689.1 1797493 1797604 + -
bmo-mir-3246 MI0014301 4 NW_004581689.1 1861443 1861587 - -
bmo-mir-3247 MI0014302 3 NW_004581689.1 3671375 3671498 + -
bmo-mir-3248 MI0014303 0 NW_004581802.1 59287 59400 + -
bmo-mir-3249 MI0014304 None NW_004581796.1 400827 400972 - -
bmo-mir-3250 MI0014305 None NW_004581752.1 1042386 1042497 - -
bmo-mir-2807d MI0014306 28 NW_004582034.1 4583916 4584064 + -
bmo-mir-3251 MI0014307 None NW_004581700.1 1994324 1994427 + -
bmo-mir-3252 MI0014308 0 NW_004581694.1 1632222 1632365 + -
bmo-mir-3253 MI0014309 0 NW_004581758.1 755220 755324 - -
bmo-mir-3254 MI0014310 2 NW_004581794.1 21362 21439 + -
bmo-mir-3255 MI0014311 None NW_004582008.1 11166950 11167051 + -
bmo-mir-3256 MI0014312 0 NW_004582019.1 1283544 1283686 - -
bmo-mir-3257 MI0014313 19 NW_004581785.1 181207 181294 + -
bmo-mir-3258 MI0014314 None NW_004582019.1 3070419 3070512 + -
bmo-mir-3259 MI0014315 None NW_004582019.1 5116402 5116507 + -
bmo-mir-3260 MI0014316 None NW_004582029.1 2205914 2206031 + -
bmo-mir-3261 MI0014317 None NW_004582023.1 1514036 1514155 + -
bmo-mir-3262 MI0014318 0 NW_004582023.1 4746742 4746870 - -
bmo-mir-3263 MI0014319 4 NW_004581708.1 1365333 1365442 + -
bmo-mir-3264 MI0014320 2 NW_004581708.1 2077154 2077287 + -
bmo-mir-3265 MI0014321 0 NW_004582031.1 2171550 2171638 + -
bmo-mir-3266 MI0014322 2 NW_004582031.1 2215958 2216088 - -
bmo-mir-3267a MI0014323 0 NW_004582031.1 4232816 4232913 + -
bmo-mir-3268 MI0014324 5 NW_004581739.1 197333 197444 - -
bmo-mir-3269 MI0014325 0 NW_004581724.1 1307877 1308005 - -
bmo-mir-3270 MI0014326 1 NW_004582033.1 29135 29231 - -
bmo-mir-3271 MI0014327 5 NW_004582033.1 358062 358203 + -
bmo-mir-3272 MI0014328 0 NW_004582033.1 3606728 3606853 + -
bmo-mir-3273 MI0014329 39 NW_004582033.1 4438178 4438318 + -
bmo-mir-3274 MI0014330 1 NW_004581731.1 1595932 1596035 + -
bmo-mir-3275 MI0014331 12 NW_004581705.1 827930 828074 + -
bmo-mir-3276 MI0014332 0 NW_004581726.1 150633 150762 + -
bmo-mir-3277 MI0014333 0 NW_004581749.1 703203 703343 - -
bmo-mir-3278 MI0014334 None NW_004582008.1 16041507 16041580 - -
bmo-mir-3279 MI0014335 0 NW_004582011.1 362277 362417 - -
bmo-mir-3280 MI0014336 0 NW_004582008.1 16172680 16172797 - -
bmo-mir-3267b MI0014338 0 NW_004581688.1 2321266 2321385 - -
bmo-mir-3282 MI0014339 0 NW_004581791.1 260592 260690 + -
bmo-mir-3283 MI0014340 None NW_004581760.1 391828 391943 + -
bmo-mir-3284 MI0014341 None NW_004582014.1 469801 469899 + -
bmo-mir-3285 MI0014342 None NW_004581779.1 535287 535418 - -
bmo-mir-3286 MI0014343 1 NW_004582008.1 4481275 4481394 + -
bmo-mir-3287 MI0014344 8 NW_004581779.1 576761 576853 - -
bmo-mir-3288 MI0014345 0 NW_004581696.1 2457700 2457822 - -
bmo-mir-3289 MI0014346 0 NW_004582036.1 53109 53203 + -
bmo-mir-3290 MI0014347 None NW_004582036.1 89142 89260 - -
bmo-mir-3291 MI0014348 0 NW_004582014.1 1625481 1625613 - -
bmo-mir-3292 MI0014349 None NW_004582036.1 1440770 1440882 - -
bmo-mir-3293 MI0014350 0 NW_004582036.1 3453543 3453691 - -
bmo-mir-3294 MI0014351 23 NW_004582382.1 365 466 - -
bmo-mir-3295 MI0014352 0 NW_004615815.1 80 192 + -
bmo-mir-3296 MI0014353 2 NW_004581840.1 53444 53525 + -
bmo-mir-3297 MI0014354 None NW_004582057.1 11225 11362 + -
bmo-mir-3298 MI0014355 0 NW_004615168.1 579 656 + -
bmo-mir-3299 MI0014356 0 NW_004581747.1 358417 358527 - -
bmo-mir-3301 MI0014358 3 NW_004582617.1 1268 1369 + -
bmo-mir-3302 MI0014359 None NW_004613033.1 302 430 + -
bmo-mir-3303 MI0014360 0 NW_004581680.1 3339998 3340080 - -
bmo-mir-3304a MI0014361 10 NW_004581680.1 946395 946522 + -
bmo-mir-3305 MI0014362 14 NW_004582029.1 682698 682822 - -
bmo-mir-3306 MI0014363 25 NW_004624444.1 3626 3755 + -
bmo-mir-3307 MI0014364 1 NW_004582844.1 2333 2471 + -
bmo-mir-3308 MI0014365 24 NW_004581689.1 1810824 1810943 - -
bmo-mir-3309 MI0014366 None NW_004581681.1 2366145 2366254 - -
bmo-mir-3310 MI0014367 1 NW_004581537.1 1355 1502 - -
bmo-mir-3311 MI0014368 0 NW_004624282.1 1284 1379 + -
bmo-mir-3312 MI0014369 5 NW_004605178.1 361 451 + -
bmo-mir-3314 MI0014372 None NW_004601752.1 140 255 + -
bmo-mir-3315 MI0014373 None NW_004601054.1 39 145 - -
bmo-mir-3316 MI0014374 2 NW_004623731.1 206 348 + -
bmo-mir-3317 MI0014375 31 NW_004581704.1 1850755 1850893 + -
bmo-mir-3318 MI0014376 0 NW_004581690.1 338052 338185 + -
bmo-mir-3319 MI0014377 None NW_004594295.1 46 174 - -
bmo-mir-3321 MI0014379 6 NW_004591337.1 296 387 + -
bmo-mir-3322 MI0014380 0 NW_004581722.1 311236 311334 + -
bmo-mir-3323 MI0014381 31 NW_004581808.1 25148 25264 - -
bmo-mir-3324 MI0014382 20 NW_004581808.1 60936 61062 - -
bmo-mir-3325 MI0014383 11 NW_004581808.1 138568 138699 + -
bmo-mir-3326 MI0014384 8 NW_004581808.1 172351 172456 + -
bmo-mir-3327 MI0014385 0 NW_004582013.1 6563612 6563716 - -
bmo-mir-3328 MI0014386 8 NW_004581808.1 308156 308271 + -
bmo-mir-3329 MI0014387 2 NW_004581745.1 1154491 1154599 - -
bmo-mir-3330 MI0014388 None NW_004622361.1 320 425 + -
bmo-mir-3332 MI0014390 2 NW_004582008.1 5026039 5026140 + -
bmo-mir-3333 MI0014391 250 NW_004620538.1 760 897 + -
bmo-mir-3334 MI0014392 273 NW_004581843.1 95977 96117 + -
bmo-mir-3335 MI0014393 None NW_004582024.1 4983561 4983683 + -
bmo-mir-3336 MI0014394 4 NW_004581884.1 20079 20163 + -
bmo-mir-3337 MI0014395 0 NW_004619603.1 110 224 - -
bmo-mir-3338 MI0014396 None NW_004582013.1 6563758 6563864 - -
bmo-mir-3339 MI0014397 2 NW_004582054.1 14179 14265 + -
bmo-mir-3340 MI0014398 12 NW_004619265.1 83 156 + -
bmo-mir-3342 MI0014400 0 NW_004618747.1 528 649 + -
bmo-mir-3343 MI0014401 None NW_004618581.1 445 549 + -
bmo-mir-3344 MI0014402 0 NW_004618373.1 671 756 + -
bmo-mir-3345 MI0014403 96 NW_004582285.1 2692 2800 + -
bmo-mir-3347a MI0014405 2 NW_004581736.1 1374869 1375012 - -
bmo-mir-3348 MI0014406 None NW_004582343.1 11056 11125 - -
bmo-mir-3350 MI0014408 18 NW_004617072.1 409 548 + -
bmo-mir-3351 MI0014409 24 NW_004582023.1 4826212 4826301 - -
bmo-mir-3352 MI0014410 None NW_004582014.1 7688755 7688865 + -
bmo-mir-3353 MI0014411 0 NW_004582014.1 8132306 8132422 - -
bmo-mir-2733j MI0014412 1 None None -
bmo-mir-2733b-2 MI0014413 1 NW_004581684.1 347220 347348 - -
bmo-mir-3354 MI0014414 0 NW_004581684.1 855330 855426 + -
bmo-mir-3355 MI0014415 4 NW_004581684.1 1447320 1447465 - -
bmo-mir-3356 MI0014416 5 NW_004581684.1 1679465 1679590 - -
bmo-mir-3357 MI0014417 None NW_004581684.1 2505348 2505446 + -
bmo-mir-3358 MI0014418 0 NW_004581684.1 2613414 2613513 - -
bmo-mir-3359 MI0014419 0 NW_004582035.1 390554 390662 - -
bmo-mir-3360 MI0014420 None NW_004582030.1 714279 714388 + -
bmo-mir-3361 MI0014421 None NW_004582030.1 4313776 4313902 + -
bmo-mir-3362 MI0014422 26 NW_004582218.1 9035 9145 + -
bmo-mir-3363 MI0014423 19 NW_004582218.1 11076 11198 + -
bmo-mir-3364 MI0014424 3 NW_004581683.1 4044106 4044210 - -
bmo-mir-3365 MI0014425 0 NW_004582021.1 1761066 1761170 - -
bmo-mir-3366 MI0014426 None NW_004582027.1 4107414 4107538 + -
bmo-mir-3367 MI0014427 None NW_004582027.1 5158760 5158858 + -
bmo-mir-3368 MI0014428 0 NW_004582020.1 3861 3980 - -
bmo-mir-3369 MI0014429 0 NW_004582020.1 264222 264338 + -
bmo-mir-3267c MI0014430 89 NW_004582020.1 1148412 1148504 - -
bmo-mir-3370 MI0014431 0 NW_004582020.1 2076049 2076185 + -
bmo-mir-3371 MI0014432 None NW_004582025.1 2741201 2741317 + -
bmo-mir-3372 MI0014433 5 NW_004603817.1 281 376 - -
bmo-mir-3373 MI0014434 1 NW_004581684.1 4316094 4316242 - -
bmo-mir-3374 MI0014435 3 NW_004581799.1 210872 210951 + -
bmo-mir-3375 MI0014436 22 NW_004610308.1 422 530 + -
bmo-mir-3377 MI0014438 63 NW_004581550.1 448 529 - -
bmo-mir-3378 MI0014439 10 NW_004589406.1 362 449 + -
bmo-mir-3381 MI0014442 0 NW_004582726.1 4511 4603 - -
bmo-mir-3382 MI0014443 18 NW_004620848.1 33 157 + -
bmo-mir-3383 MI0014444 6 NW_004619543.1 599 676 + -
bmo-mir-3384 MI0014445 14 NW_004582011.1 8190596 8190726 - -
bmo-mir-3385 MI0014446 10 NW_004582162.1 8709 8831 + -
bmo-mir-3386 MI0014447 18 NW_004582162.1 17439 17587 + -
bmo-mir-3387 MI0014448 34 NW_004582012.1 8227703 8227851 - -
bmo-mir-3388 MI0014449 0 NW_004581739.1 115208 115342 + -
bmo-mir-3389 MI0014450 7 NW_004587066.1 348 464 + -
bmo-mir-2733i MI0014452 1 NW_004581684.1 344891 344998 - -
bmo-mir-2733a-3 MI0014453 1 NW_004581684.1 346598 346745 - -
bmo-mir-3391 MI0014454 4 NW_004581679.1 3279236 3279345 + -
bmo-mir-3392 MI0014455 0 NW_004582016.1 998832 998942 - -
bmo-mir-3393 MI0014456 None NW_004581740.1 686617 686743 + -
bmo-mir-3394 MI0014457 0 NW_004581756.1 226007 226128 - -
bmo-mir-3395 MI0014458 4 NW_004581756.1 230693 230814 - -
bmo-mir-3396 MI0014459 4 NW_004581756.1 232166 232309 - -
bmo-mir-3397 MI0014460 0 NW_004581685.1 3631919 3632028 + -
bmo-mir-3398 MI0014461 0 NW_004581685.1 4026173 4026271 - -
bmo-mir-3399 MI0014462 22 NW_004581840.1 8243 8329 - -
bmo-mir-3400 MI0014463 1 NW_004581840.1 73681 73786 - -
bmo-mir-3401 MI0014464 0 NW_004581840.1 195072 195162 - -
bmo-mir-3402 MI0014465 4 NW_004581799.1 344225 344341 + -
bmo-mir-3403 MI0014466 103 NW_004581799.1 393613 393736 + -
bmo-mir-3347b MI0014467 0 NW_004581825.1 86588 86697 + -
bmo-mir-3404 MI0014468 35 NW_004581825.1 112200 112345 + -
bmo-mir-3405 MI0014469 20 NW_004581825.1 161550 161697 - -
bmo-mir-3406 MI0014470 41 NW_004581707.1 1075057 1075183 + -
bmo-mir-3407 MI0014471 None NW_004581728.1 414588 414686 - -
bmo-mir-3408 MI0014472 0 NW_004582015.1 444762 444864 - -
bmo-mir-3409 MI0014473 None NW_004581746.1 936073 936156 + -
bmo-mir-3410 MI0014474 None NW_004581697.1 2417069 2417171 - -
bmo-mir-3411 MI0014475 0 NW_004581777.1 165655 165752 + -
bmo-mir-3412 MI0014476 None NW_004581706.1 1352720 1352829 - -
bmo-mir-3413 MI0014477 None NW_004581695.1 3171542 3171639 + -
bmo-mir-3414 MI0014478 13 NW_004581707.1 1075363 1075462 - -
bmo-mir-3415 MI0014479 None NW_004581695.1 3223757 3223855 - -
bmo-mir-3416 MI0014480 16 NW_004581793.1 248032 248179 + -
bmo-mir-3417 MI0014481 None NW_004582015.1 2052671 2052800 - -
bmo-mir-3418 MI0014482 0 NW_004581759.1 943693 943815 - -
bmo-mir-3419 MI0014483 0 NW_004582015.1 3183187 3183311 - -
bmo-mir-989b MI0014484 None NW_004582026.1 2823459 2823579 - -
bmo-mir-3420 MI0014485 1 NW_004581739.1 253066 253176 - -
bmo-mir-3421 MI0014486 0 NW_004582026.1 5987644 5987792 + -
bmo-mir-3422 MI0014487 None NW_004581682.1 80279 80377 + -
bmo-mir-3423 MI0014488 1 NW_004581682.1 547848 547962 - -
bmo-mir-3424 MI0014489 4 NW_004581792.1 146859 146990 + -
bmo-mir-3425 MI0014490 None NW_004581769.1 1440 1555 - -
bmo-mir-3426 MI0014491 None NW_004582015.1 4343568 4343684 - -
bmo-mir-3427 MI0014492 0 NW_004581716.1 1208293 1208403 - -
bmo-mir-3428 MI0014493 None NW_004582012.1 325213 325317 - -
bmo-mir-3429 MI0014494 0 NW_004582012.1 2405754 2405855 - -
bmo-mir-3204b MI0014495 2 NW_004582015.1 5514235 5514322 + -
bmo-mir-3430 MI0014496 None NW_004581737.1 91219 91364 - -



Comments or questions? Email mirbase@manchester.ac.uk