Accession
MI0035855
Description
Lotus japonicus
lja-MIR11103c precursor miRNA
Sequence
2287
reads,
217.0
reads per million, 9 experiments
aacuaggggaugggauccucuccaguggauuuuccucaagUUUUCUCCAGUGGACAUUUGUggcgguuuggaaccgccacaaaauguuggaugcugccacaaaaucuaucaauuuuuugcagcaccauuuuguggcagcuucacagacauuuuguggcgguuccaaaccgccacaaaauuccacuggagacaauaugaggaaaAUCUACUGGAGAGGAUCUGGACCCuugaacuaguu
...((((((.(.((((((((((((((((((((((((((.(((.(((((((((((..(((((((((((((((((((((((((((((((((((.(((((((((((((((..(((....))).))....))))))))))))).)).)).)))))))))))))))))))))))))))))))..))))))))))).))).)))))))))))))))))))))))))).).))))))........
...((((((.(.((((((((((((((((((((((((((.(((.(((((((((((..(((((((((((((((((((((((((((((((((((.(((((((((((((((..(((....))).))....))))))))))))).)).)).)))))))))))))))))))))))))))))))..))))))))))).))).)))))))))))))))))))))))))).).))))))........
Structure
-----aac a g a U CA - - u ---- au u
uagggg u ggauccucuccaguggauuuuccuca gUU UCUCCAGUGGA UUUGUggcgguuuggaaccgccacaaaaugu ug ga gcugccacaaaau cu caa u
|||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||| || |||
guuCCC G UCUAGGAGAGGUCAUCUAaaaggagu uaa agaggucaccu aaacaccgccaaaccuuggcgguguuuuaca ac cu cgacgguguuuua ga guu u
uugaucaa A G a c ua g a u ccac -c u
Annotation confidence
Low
Do you think this miRNA is real?
Genome context
Chr4: 4033488-4033725 [+]
Database links
Mature lja-miR11103c-5p
| Accession | MIMAT0043854 |
| Description | Lotus japonicus lja-miR11103c-5p mature miRNA |
| Sequence | 41 - UUUUCUCCAGUGGACAUUUGU - 61 |
| Evidence |
experimental
Illumina [1] |
Mature lja-miR11103c-3p
| Accession | MIMAT0043855 |
| Description | Lotus japonicus lja-miR11103c-3p mature miRNA |
| Sequence | 204 - AUCUACUGGAGAGGAUCUGGACCC - 227 |
| Evidence |
experimental
Illumina [1] |
References
|
