Accession
MI0027691
Description
Gossypium raimondii
gra-MIR8709c precursor miRNA
Sequence
2009
reads,
400.0
reads per million, 13 experiments
aauaucaauuAUACAUGAACUUCGAUUUAAuaugcaauuuuguacaugaacuuugauuuuggacaauuuuauaaauggcauuuugauuugaucuaauucucaaaaauuauuaacauaguuauugauauagaaucauuuuauuuuuauauauugcauacacaaauaauuauauuuauccaauauaaaaauaauuugauuauuuauuucuuuagauguacaugauuuaaucaaaauuaaaguuucauguauauaauugCAUUAAAUCAAAGUUCAUGgaucaaaaugcacauuaaaucaaaauucauguauaauuuugagauu
......(((((((((((((.((.((((((((.((((.(((((..(((((((((((((((....(((((.((((.((((.(((((((((((((..((((.((((.((((((....)))))).)))).....(((((..((((((((((((..((.(((....((((....))))))).))))))))))))))..)))))(((((......)))))......))))..))).)))))))))).)))).)))).)))))....)))))))))))))))...))))))))).)))))))).)).)))))))))))))........
......(((((((((((((.((.((((((((.((((.(((((..(((((((((((((((....(((((.((((.((((.(((((((((((((..((((.((((.((((((....)))))).)))).....(((((..((((((((((((..((.(((....((((....))))))).))))))))))))))..)))))(((((......)))))......))))..))).)))))))))).)))).)))).)))))....)))))))))))))))...))))))))).)))))))).)).)))))))))))))........
Structure
--aauauc C C a a -ua ugga u a c - cu cucaaaaauuauuaacauaguuauugauauag uu au c caca a
aauuAUACAUGAA UU GAUUUAAu ugca uuuug caugaacuuugauuu caauu uaua augg auuuugauuu gau aauu aauca uuauuuuuauau ug aua aaua u
||||||||||||| || |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||| || ||| ||||
uuaauauguacuu aa cuaaauua acgu aaaac GUACUUGAAACUAAA guuaa auau uacu ugaaauuaaa cua uuag uuagu aauaaaaauaua ac uau uuau u
uuagaguu a a c - uag UUAC u g u a au ----------uacauguagauuucuuuauuua uu -- c ---- a
Annotation confidence
Low
Do you think this miRNA is real?
Genome context
chr5: 52808244-52808564 [+]
Database links
Mature gra-miR8709c-5p
| Accession | MIMAT0034096 |
| Description | Gossypium raimondii gra-miR8709c-5p mature miRNA |
| Sequence | 11 - AUACAUGAACUUCGAUUUAA - 30 |
| Evidence |
experimental
Illumina [1] |
Mature gra-miR8709c-3p
| Accession | MIMAT0055431 |
| Description | Gossypium raimondii gra-miR8709c-3p mature miRNA |
| Sequence | 257 - CAUUAAAUCAAAGUUCAUG - 275 |
| Evidence |
experimental
unknown |
References
|
