Accession
MI0027484
Description
Amborella trichopoda
atr-MIR8595 precursor miRNA
Sequence
894
reads,
443
reads per million, 4 experiments
gggguaaaugaguguggaugaugagccccuacccauuuuuugaaauagucaauuuuugaauacguuggugauaauggaggcuaaggccuucaauuggggcucaggugguaccaccacgucucgagccuauuucugauaucgguauuaagaaugaggcugggguuguggugguaguaccacuugagCCCUAGUUGAAGGUCUUGGCCuccauucucacuaauguauucaaaaaguugauuauuucaaaaauggguaggggcucuucauccacacucacuuacccc
(((((((.(((((((((((((.((((((((((((((((((.((((((((((((((((((((((((((((((.((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.(((.(((((..((((((((....)))).))))..))))).))).)))))))))...))))))))))))))))))))))))))))))))))))).)))))))))))))).)))))))))))))))))))))))))))))))))).))))))))))))).)))))))
(((((((.(((((((((((((.((((((((((((((((((.((((((((((((((((((((((((((((((.((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.(((.(((((..((((((((....)))).))))..))))).))).)))))))))...))))))))))))))))))))))))))))))))))))).)))))))))))))).)))))))))))))))))))))))))))))))))).))))))))))))).)))))))
Structure
a u u - u --- u g au - u
gggguaa ugaguguggauga gagccccuacccauuuuu gaaauagucaauuuuu gaauacguugguga aauggaggcuaaggccuucaauuggggcucagguggu accaccacg cuc agccu uucu gaua c
||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||| ||||
ccccauu acucacaccuacu cucggggauggguaaaaa cuuuauuaguugaaaa cuuauguaaucacu uuaccuCCGGUUCUGGAAGUUGAUCCCgaguucacca ugguggugu ggg ucgga aaga uuau g
c u - a c uga u g gu a g
Annotation confidence
Low
Do you think this miRNA is real?
Genome context
scaffold00086: 1853597-1853880 [+]
Database links
Mature atr-miR8595
| Accession | MIMAT0033884 |
| Description | Amborella trichopoda atr-miR8595 mature miRNA |
| Sequence | 186 - CCCUAGUUGAAGGUCUUGGCC - 206 |
| Evidence |
experimental
Illumina [1] |
References
|
