Accession
MI0027466
Description
Amborella trichopoda
atr-MIR8581 precursor miRNA
Sequence
1670
reads,
550
reads per million, 4 experiments
uuaacauccuaaucgucguacuaaaauucucucauuguugguacuuaucuauauguuucgcauauggguguuugagagaggguuucugccgaacucaaguccccgacccgugaccucuuugggcucguagaaaaucuaggucaaucaaguugguggaccuaguuuuuccaucggccugaagaggucucgggucggggacccagguuugggaggaagacucucccuuagaacaaccacaagcaaagcguguggauagguaccaaugaUGAGAGAAUUUUGGUAUGACGACUagggugcuag
....(((((((.((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.((...(((.(((((..(((((..(((((.(((((((...((((((((((((.((((((((((((((.((.(((((.(((((((.((((...)))).))))))).))))).)).)))))))))))))).))))))))))))...))))))).)))))..))))).....))))).)))...)).)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))).)))))))....
....(((((((.((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.((...(((.(((((..(((((..(((((.(((((((...((((((((((((.((((((((((((((.((.(((((.(((((((.((((...)))).))))))).))))).)).)))))))))))))).))))))))))))...))))))).)))))..))))).....))))).)))...)).)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))).)))))))....
Structure
uuaa a c aua g ---ga gg g caa u c a u a a
cauccua ucgucguacuaaaauucucucauuguugguacuuaucuauauguuu gc ugg uguuu gagag uuucu ccgaacu guccccgacccg gaccucuuugggcu gu gaaaa cuagguc auca
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||| |||| g
gugggaU AGCAGUAUGGUUUUAAGAGAGUaguaaccauggauaggugugcgaa cg acc acaag cucuc aagga gguuugg caggggcugggc cuggagaaguccgg ua cuuuu gauccag uggu
gauc C a aac a auucc ag g acc u c c u g u
Annotation confidence
Low
Do you think this miRNA is real?
Genome context
scaffold00037: 1871777-1872076 [-]
Database links
Mature atr-miR8581
| Accession | MIMAT0033865 |
| Description | Amborella trichopoda atr-miR8581 mature miRNA |
| Sequence | 267 - UGAGAGAAUUUUGGUAUGACGACU - 290 |
| Evidence |
experimental
Illumina [1] |
References
|
