Accession
MI0027452
Description
Amborella trichopoda
atr-MIR8565e precursor miRNA
Sequence
2927
reads,
1042
reads per million, 4 experiments
augaauuuuuaguuucaguaauaauaauaaagaguaaugauccuaugagacccucccacacccauguauguaggaccccaaaggaucaccauuaaaUUUGGCACAGAUCUCUAGAAAAGUuaucacaugagugugggacuugacuuuucuagagaucugugccaaauuuaaugaugaucauuugggguccuacacacaugggugugagagggucucauaggaucauuacucaauaauaaauaaaagaaaaaagaagaugcau
.((((........))))..............((((((((((((((((((((((((.(((((((((((.((((((((((((((.(((((.((((((((((((((((((((((((((((((((((((((....)))))....))))))))))))))))))))))))))))))))).))))).)))))))))))))).))))))))))).))))))))))))))))))))))))...............................
.((((........))))..............((((((((((((((((((((((((.(((((((((((.((((((((((((((.(((((.((((((((((((((((((((((((((((((((((((((....)))))....))))))))))))))))))))))))))))))))).))))).)))))))))))))).))))))))))).))))))))))))))))))))))))...............................
Structure
augaauuuuuaguuucaguaauaauaauaaa c a g c ---- u
gaguaaugauccuaugagacccuc cacacccaugu uguaggaccccaaa gauca cauuaaaUUUGGCACAGAUCUCUAGAAAAGUua ucaca g
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
cucauuacuaggauacucugggag guguggguaca acauccugggguuu cuagu guaauuuaaaccgugucuagagaucuuuucagu ggugu a
uacguagaagaaaaaagaaaauaaauaauaa a c a a ucag g
Annotation confidence
Not enough data
Do you think this miRNA is real?
Genome context
scaffold00159: 262391-262652 [+]
Database links
Mature atr-miR8565e
| Accession | MIMAT0033850 |
| Description | Amborella trichopoda atr-miR8565e mature miRNA |
| Sequence | 97 - UUUGGCACAGAUCUCUAGAAAAGU - 120 |
| Evidence |
experimental
Illumina [1] |
References
|
