Accession
MI0022022
Description
Populus trichocarpa
ptc-MIR6447 precursor miRNA
Sequence
ggccggguuucaaaacuaugaggucaaauuuucuuauauucgucacuuuuugucaauucgauccaauuggacugaacaauguaguauccuugaagcacuuggucauacuuuguuuacaaauaagucuaauuagucugaaUUGACGAAAUGUGACGACUACaaggugauauugaugaaauuuuauucuuuggagcuuguuugcc
((((((((((((((...(((((((((((((.((((.((.(((((((.(((((((((((((..(.(((((((((((((((.(((....((..(.....)..))...))).)))))).......))))))))).)..))))))))))))).))))))).)).)))).))).))))).....)))))..)))))))))))...)))
((((((((((((((...(((((((((((((.((((.((.(((((((.(((((((((((((..(.(((((((((((((((.(((....((..(.....)..))...))).)))))).......))))))))).)..))))))))))))).))))))).)).)))).))).))))).....)))))..)))))))))))...)))
Structure
--- acu ----- - u a u u au c ------- u guau uu a ggc cggguuucaaa augag gucaa auu ucuu ua ucgucac uuuugucaauucg c aauuggacu gaacaa gua cc g a ||| ||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| || ||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||| || | g ccg guucgagguuu uauuu uaguu uag ggaa AU AGCAGUG AAAGCAGUUaagu g uuaaucuga uuuguu cau gg c c uuu -cu uaaag a u C C U cu a auaaaca u -acu uu a
Annotation confidence
Not enough data
Do you think this miRNA is real?
Genome context
CM000350.2: 5281844-5282046 [-]
Database links
Mature ptc-miR6447
| Accession | MIMAT0025250 |
| Description | Populus trichocarpa ptc-miR6447 mature miRNA |
| Sequence | 140 - UUGACGAAAUGUGACGACUAC - 160 |
| Evidence |
experimental
miRNAseq [1] |
References
|
