Accession
MI0022014
Description
Populus trichocarpa
ptc-MIR6439a precursor miRNA
Sequence
ucauguaaagugaaugcugaguaagaagCCAAAUGAAGAAGCAGAAGCCaucacuagcgccgcccuaauuaaaugcucaacccgucauuuugaucgcaacgaguuuucaucugcauaugggaagauuuucauggagaagaaugcuguagcauucaguuaagucugauugcaaaccucgugauguauugagcauuuacuuaauaugcugauggugacuucugcuucuugauuuggugccugaaucaacauuaacuuuucauga
(((((.(((((.((((.(((...((..(((((((.((((((((((((.(((((.(((((......(((.(((((((((((..((((((..........((.(((.(((.(((.((..(((((....))))))).))).))).))))).(((.((((......)))).))).......))))))..))))))))))).)))...))))).))))).)))))))))))).)))))))..))...))).)))).))))).)))))
(((((.(((((.((((.(((...((..(((((((.((((((((((((.(((((.(((((......(((.(((((((((((..((((((..........((.(((.(((.(((.((..(((((....))))))).))).))).))))).(((.((((......)))).))).......))))))..))))))))))).)))...))))).))))).)))))))))))).)))))))..))...))).)))).))))).)))))
Structure
u g c gua aa G C c ccgccc u cc --------------------uuugaucgca g u a g ua a
ucaug aaagu aaug uga ag gCCAAAU AAGAAGCAGAAG Cauca uagcg uaa uaaaugcucaa cgucau ac agu uuc ucu ca uggga g
||||| ||||| |||| ||| || ||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||| || ||| ||| ||| || |||||
aguac uuuca uuac acu uc ugguuua uucuucgucuuc guggu gucgu auu auuuacgaguu guagug ug ucg aag aga gu acuuu a
u a a aag cg g a a ---aua c au cuccaaacguuagucugaauugacuuacga - u a g -- u
Annotation confidence
Not enough data
Do you think this miRNA is real?
Genome context
CM000347.2: 1164654-1164915 [+]
Database links
Mature ptc-miR6439a
| Accession | MIMAT0025242 |
| Description | Populus trichocarpa ptc-miR6439a mature miRNA |
| Sequence | 29 - CCAAAUGAAGAAGCAGAAGCC - 49 |
| Evidence |
experimental
miRNAseq [1] |
References
|
