Accession
MI0018296
Description
Medicago truncatula
mtr-MIR2592as precursor miRNA
Literature search
1 open access papers mention mtr-MIR2592as
(2 sentences)
(2 sentences)
Sequence
341511
reads,
957.0
reads per million, 111 experiments
aucaacaacuugauuccgccagaagaucgucauuaguuaggguaaagugcauuccaacugcaacaauugucuuaccuuugaaugagauaaauucaaacaugucaaaCAACAGGACUCGAGCAUUUCGcucggcauucauguuuuucuuuugaaaagauuaaauucuuguuaggcugguuuagaugaagguauuaagugucaaggaaugaaccucauuucguuggcaauugaauaccaucaucuaaagcaagccuaacaaaaauuuauucuuuucaaaggaaaacaugaaugucgagcgaaaugcuugaguccaguauguuugguagguuugaauuuaucacauucaaauguaagauaauuguuggaguuggaaugaacauuccaagugcAACAAUUGUCUUACUCUGGAUGGGgcaau
.........(((.((((((((((((((.((..((.((...((.((.((.((((((((((.(((((((((((((((.((((((((.(((((((((((((.(((((((((((.(((((((((((((((((((((((((((((((((.((((((((((((.((((((.(((((((((((.(((((((((.((((((...(((((((((((((...))))))).))))))....)))))).))))))))).).)))))))))).)))))).))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))).)).))))))))).))))))))))))).)))))))).))))))))))))))).)))))))))).)).))))....))))..)).))))...))))).)))))))).
.........(((.((((((((((((((.((..((.((...((.((.((.((((((((((.(((((((((((((((.((((((((.(((((((((((((.(((((((((((.(((((((((((((((((((((((((((((((((.((((((((((((.((((((.(((((((((((.(((((((((.((((((...(((((((((((((...))))))).))))))....)))))).))))))))).).)))))))))).)))))).))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))).)).))))))))).))))))))))))).)))))))).))))))))))))))).)))))))))).)).))))....))))..)).))))...))))).)))))))).
Structure
aucaacaac a - --- c ca a -uag u a g g c a a - A u u c - g a -aag - a
uug uuccg ccaga agau gu uu gu gg aa gu cauuccaacu caacaauugucuuac uuugaaug gauaaauucaaac ugucaaaCA AC GGACUCGAGCAUUUCGcucggcauucauguuuu cuuuugaaaaga uaaauu uuguuaggcu g uuuagauga gguauu ugucaa ggaauga
||| ||||| ||||| |||| || || || || || || |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||| | ||||||||| |||||| |||||| ||||||| c
aac gGGGU GGUCU UCUG UA AA cg cc uu ca guaagguuga guuguuaauagaaug aaacuuac cuauuuaaguuug augguuugu ug ccugaguucguaaagcgagcuguaaguacaaaa ggaaacuuuucu auuuaa aacaauccga c aaaucuacu ccauaa acgguu cuuuacu
--------u - A CAU U AC - ugaa - a a g u a g a a - u a a g a guua g c
Annotation confidence
Low
Do you think this miRNA is real?
Genome context
chr3: 37750179-37750596 [-]
Database links
Mature mtr-miR2592as-5p
| Accession | MIMAT0021190 |
| Description | Medicago truncatula mtr-miR2592as-5p mature miRNA |
| Sequence | 107 - CAACAGGACUCGAGCAUUUCG - 127 |
| Evidence |
experimental
Illumina [1] |
Mature mtr-miR2592as-3p
| Accession | MIMAT0055069 |
| Description | Medicago truncatula mtr-miR2592as-3p mature miRNA |
| Sequence | 390 - AACAAUUGUCUUACUCUGGAUGGG - 413 |
| Evidence |
experimental
unknown |
References
|
