Accession
MI0010928
Description
Sorghum bicolor
sbi-MIR821d precursor miRNA
Sequence
532
reads,
31.0
reads per million, 45 experiments
aaaaAGUCAUCAACAACAAAGUUGUAGAaaucauuaauaucuaaaacuuuuauuuuggucauuuauccauucgauaaagugauagcaacauuguucauaaauuuuacaaaucccucguaugguuucauaaacuauaagagagauauguaaauuuugugaacaauauuacuaucacuuucucggaugaacaaauaccuaaaauaaaaguuguauauauugaugaguucuacaacuuuuauguucaugaauuuuucgaaugaaauc
(((((.((((.((((..((((((((((((.((((((((((.((.(((((((((((((((.((((...(((((((.((((((((((.((.((((((((((((.((((((.(((.(((.((((((((...)))))))).))).))).)))))).)))))))))))).)).)))))))))).)))))))...))))))).)))))))))))).)).)))))))))).))))))))))))..)))).)))).)))))...........
(((((.((((.((((..((((((((((((.((((((((((.((.(((((((((((((((.((((...(((((((.((((((((((.((.((((((((((((.((((((.(((.(((.((((((((...)))))))).))).))).)))))).)))))))))))).)).)))))))))).)))))))...))))))).)))))))))))).)).)))))))))).))))))))))))..)))).)))).)))))...........
Structure
----------- G C AC a c a - c auc u c c u a c g c
aaaaA UCAU AACA AAAGUUGUAGAa ucauuaauau ua aacuuuuauuuu ggu auuu cauucga aaagugauag aa auuguucauaaa uuuaca auc cuc uaugguuu
||||| |||| |||| |||||||||||| |||||||||| || |||||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||| || |||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||| a
uuuuu agua uugu uuucaacaucuu aguaguuaua au uugaaaauaaaa cca uaaa guaggcu uuucacuauc uu uaacaaguguuu aaaugu uag gag auaucaaa
cuaaaguaagc a c au g u g u - caa c a a u a a a u
Annotation confidence
Not enough data
Do you think this miRNA is real?
Genome context
chr6: 29629764-29630027 [+]
Database links
Mature sbi-miR821d-5p
| Accession | MIMAT0011388 |
| Description | Sorghum bicolor sbi-miR821d-5p mature miRNA |
| Sequence | 5 - AGUCAUCAACAACAAAGUUGUAGA - 28 |
| Evidence | not_experimental |
Mature sbi-miR821e-5p
| Accession | MIMAT0011389 |
| Description | Sorghum bicolor sbi-miR821e-5p mature miRNA |
| Sequence | 5 - AGUCAUCAACAACAAAGUUGUAGA - 28 |
| Evidence | not_experimental |
References
|
