Accession
MI0005705
Description
Chlamydomonas reinhardtii
cre-MIR912 precursor miRNA
Sequence
gccuaugccucugccggccaucaauggcgcucacgacaagggugccaucgucaccggucuaaucuaaugccaggcaaccagggaagacacaggauccauuuucuagugccuggcugggaucaaugcaagaugauaguuggauccuggacgccgaaggccaucaugcggugucaaccgcaugacggccguuggcguccaggaucuagcugucgucuUGGAUUGAUCCCAGCCAGGCgcuuggagauggacccacggucuucccucccuuguugccuggguuccgagcagaccggcgacgauggcaccaccgucguuggcuccagggcauugacggcccggcggagaaccaggc
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Structure
augc - a g ----- c aag a aa uaaug ----c aca a u g a a g
gccu cucugccgg cc ucaaug c gcu acgac ggugccaucguc ccggucu uc ccaggcaac agggaagac gg uccauuuuc agugccuggcugggaucaau caagaugauaguuggauccuggacgccga ggcc ucaugcggu u
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ccaa c c g gaccu u cca c cg ccuug uuccc gca c u G g c a
Annotation confidence
Not enough data
Do you think this miRNA is real?
Comments
Molner et al. confirm that the mature miRNA product identified by Zhao et al. and shown here is the predominant one [2]. They also identify 3 further minor products from the same hairpin, not shown here.
Genome context
scaffold_35: 929764-930115 [-]
Database links
Mature cre-miR912
| Accession | MIMAT0004395 |
| Description | Chlamydomonas reinhardtii cre-miR912 mature miRNA |
| Sequence | 216 - UGGAUUGAUCCCAGCCAGGC - 235 |
| Evidence |
experimental
cloned [1-2] |
References
|
