Accession
MI0029098
Description
Solanum lycopersicum
sly-MIR319b precursor miRNA
Gene family
MIPF0000010;
MIR159
Literature search
22 open access papers mention sly-MIR319b
(171 sentences)
(171 sentences)
Sequence
guccccuuuuuuaagauucuaauuuugugauuuagauguaauguggaagaugguauaagagagcuuccuuuaguccacucauagguagacgaaggauuugaauuaucucccgacucauucauucaaacgcaauaggaaguauguaaucuuauacuauugugaaugugugaaugaugcgggagauaaauucucuccuuuuuaucugugcUUGGACUGAAGGGAGCUCCCUuuuaccuucuuucuucgguuucuuuuagucgaauugguuucuuaugaauuaguuguuuggggc
(((((..(((.(((((..(((((((...((((.(((........((((((.((((.(((.(((((((((((((((((..((((((((((..(((((...(((((((((((((..((((((((.((..((((((((.(((........)))...))))))))..)).))))))))..)))))))).)))))..)))))))))))))))..))))))))))))))))).))).)))).)))))).......)))...)))))))))))..))))).)))..........)))))
(((((..(((.(((((..(((((((...((((.(((........((((((.((((.(((.(((((((((((((((((..((((((((((..(((((...(((((((((((((..((((((((.((..((((((((.(((........)))...))))))))..)).))))))))..)))))))).)))))..)))))))))))))))..))))))))))))))))).))).)))).)))))).......)))...)))))))))))..))))).)))..........)))))
Structure
--------cu u uu ugu --u uguaaugu u u a cu cg uuu - ac u aa --g uau
guccc uuu uaaga cuaauuu gauu aga ggaaga ggua aag gagcuuccuuuagucca cauagguaga aagga gaauu aucucccg ucauucau ca cgcaauag aag g
||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||| |||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| |||
cgggg aag auucu gguuaag cuga ucu cuuucu ccau uUC CUCGAGGGAAGUCAGGU gugucuauuu uuccu cuuaa uagagggc aguaagug gu guguuauc uuc u
uuuguugauu u uu --- uuu -uuggcuu u u C Uc -- -cu a gu u aa aua uaa
Annotation confidence
Not enough data
Do you think this miRNA is real?
Genome context
chr6: 1551676-1551967 [+]
Database links
Mature sly-miR319b
| Accession | MIMAT0035430 |
| Description | Solanum lycopersicum sly-miR319b mature miRNA |
| Sequence | 209 - UUGGACUGAAGGGAGCUCCCU - 229 |
| Evidence |
experimental
Illumina [1] |
References
|
