Accession
MI0014601
Description
Arabidopsis lyrata
aly-MIR822 precursor miRNA
Gene family
MIPF0001199;
MIR822
Sequence
17
reads,
593
reads per million, 1 experiments
auggggAUGUAACGCAUGUUGUUUUCUgcgaggagcauuuguacauguuucauguagcaugaaaucacauuccauacaugaauaguaauuaccuuagauaggacauuguacugcuugaaaaaacuuguuaacgucauaaaauuuaugaugaaaacaccuauaaaaaguguuuuuucaagcauguguccaugagaguaauuuuuauucauauaugacaugugauuucauccuucauaaaaugugugcaaaugcuuuccacagGAAACAACAUACGUUACAUCCcaucua
...(((((((((((.(((((((((((((.(.(((((((((((((((((((.(((.((.((((((((((((..((((.((((((((.((((((((((....((((((.....(((((((((((((.((((..((((((((...))))))))..))))............))))))))))))).)))))).)))).)))))).)))))))).))))..)))))))))))).)).))).))))))))))))))))))).).))))))))))))).))))))))))).....
...(((((((((((.(((((((((((((.(.(((((((((((((((((((.(((.((.((((((((((((..((((.((((((((.((((((((((....((((((.....(((((((((((((.((((..((((((((...))))))))..))))............))))))))))))).)))))).)))).)))))).)))))))).))))..)))))))))))).)).))).))))))))))))))))))).).))))))))))))).))))))))))).....
Structure
--aug C c a c u c uc c u - gaua uguac -----------u aa a
gggAUGUAACG AUGUUGUUUUCUg g ggagcauuuguacauguuu aug ag augaaaucacau caua augaauag aauuac cuua ggacau ugcuugaaaaaac uguu cgucauaa
||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||| |||| |||||||| a
cCCUACAUUGC UACAACAAAGgac c uuucguaaacguguguaaa uac uc uacuuuagugua guau uacuuauu uuaaug gagu ccugug acgaacuuuuuug acaa guaguauu
aucua A a c a u c ca a u a ---a ----u ugaaaaauaucc aa u
Annotation confidence
Not enough data
Do you think this miRNA is real?
Genome context
GL348718.1: 1060462-1060749 [-]
Database links
Mature aly-miR822-5p
| Accession | MIMAT0017599 |
| Description | Arabidopsis lyrata aly-miR822-5p mature miRNA |
| Sequence | 7 - AUGUAACGCAUGUUGUUUUCU - 27 |
| Evidence |
experimental
Illumina [1], SOLiD [2] |
| Database links |
|
Mature aly-miR822-3p
| Accession | MIMAT0017600 |
| Description | Arabidopsis lyrata aly-miR822-3p mature miRNA |
| Sequence | 262 - GAAACAACAUACGUUACAUCC - 282 |
| Evidence |
experimental
Illumina [1], SOLiD [2] |
References
|
