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miRBase |
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Stem-loop sequence osa-MIR2118a |
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Accession | MI0011251 (change log) | |||||||||||||||||||||||
Description | Oryza sativa miR2118a stem-loop | |||||||||||||||||||||||
Gene family | MIPF0000745; MIR2118 | |||||||||||||||||||||||
Literature search |
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29 open access papers mention osa-MIR2118a | |||||||||||||||||||||||
Stem-loop |
g aaaga c ua c -a a -- ucu caucua cc ucc g 5' ggaagaggaag gagg uccaagag guagga uggga cau ugagaaagcau gagc auc uccauc c cauuc c ||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||| ||| ||||||||||| |||| ||| |||||| | ||||| 3' ccuucuccuuc cuuc agguucuu uauccu acccu gua gcucuuuugua cucg uag aggugg g guaag u - ----- a gc u cc - uu cuu ------ ac -uu a |
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Deep sequencing |
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Confidence |
Annotation confidence: not enough data
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Genome context |
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Clustered miRNAs |
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Database links |
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Mature sequence osa-miR2118a |
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Accession | MIMAT0011740 |
Sequence |
131 - uucucgaugccucccauuccua - 152 |
Evidence | experimental; 454 [1] |
References |
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1 |
PMID:19584097
"Clusters and superclusters of phased small RNAs in the developing inflorescence of rice"
Genome Res. 19:1429-1440(2009).
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