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miRBase |
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Stem-loop sequence mmu-mir-1193 |
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Accession | MI0006298 (change log) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Symbol | MGI:Mir1193 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | Mus musculus miR-1193 stem-loop | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene family | MIPF0000714; mir-1193 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Literature search |
3 open access papers mention mmu-mir-1193 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Stem-loop |
cugaagggacaaugaugcccac u cg a c u - c g - uuc 5' ug ucu gggu g ug guggaugguaga c ggugac uaca c a || ||| |||| | || |||||||||||| | |||||| |||| | u 3' ac aga ccca c ac caccuaucauuu g ccacug augu g u ------------------gucu c -- - a - u c g c uau |
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Deep sequencing |
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Confidence |
Annotation confidence: high
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Genome context |
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Clustered miRNAs |
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Database links |
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Mature sequence mmu-miR-1193-5p |
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Accession | MIMAT0017329 |
Sequence |
46 - ugguagaccggugacguaca - 65 |
Deep sequencing | 1000 reads, 48 experiments |
Evidence | experimental; Illumina [3] |
Database links |
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Predicted targets |
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Mature sequence mmu-miR-1193-3p |
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Accession | MIMAT0005851 |
Previous IDs | mmu-miR-1193 |
Sequence |
80 - uaggucacccguuuuacuauc - 100 |
Deep sequencing | 2650 reads, 54 experiments |
Evidence | experimental; 454 [1], Illumina [2-3] |
Database links |
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Predicted targets |
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References |
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1 |
PMID:17989215
"RNA sequence analysis defines Dicer's role in mouse embryonic stem cells"
Proc Natl Acad Sci U S A. 104:18097-18102(2007).
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2 |
PMID:20215419
"MicroRNA transcriptome in the newborn mouse ovaries determined by massive parallel sequencing"
Mol Hum Reprod. 16:463-471(2010).
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3 |
PMID:20413612
"Mammalian microRNAs: experimental evaluation of novel and previously annotated genes"
Genes Dev. 24:992-1009(2010).
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