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miRBase |
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Stem-loop sequence mmu-mir-654 |
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Accession | MI0005520 (change log) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Symbol | MGI:Mir654 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | Mus musculus miR-654 stem-loop | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene family | MIPF0000409; mir-654 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Literature search |
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11 open access papers mention mmu-mir-654 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Stem-loop |
------ uaagu gaa aagcu a uguuu 5' cucgg gg gauggu gcaga caugug c ||||| || |||||| ||||| |||||| 3' ggguu cc cuacca cgucu guauac u gucucu ----u --a ---gu - uguac |
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Deep sequencing |
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Confidence |
Annotation confidence: high
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Genome context |
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Clustered miRNAs |
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Database links |
Mature sequence mmu-miR-654-5p |
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Accession | MIMAT0004897 |
Sequence |
18 - ugguaagcugcagaacaugugu - 39 |
Deep sequencing | 1 reads, 1 experiments |
Evidence | experimental; Illumina [2] |
Predicted targets |
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Mature sequence mmu-miR-654-3p |
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Accession | MIMAT0004898 |
Sequence |
53 - uaugucugcugaccaucaccuu - 74 |
Deep sequencing | 685 reads, 12 experiments |
Evidence | experimental; Illumina [2] |
Predicted targets |
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References |
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1 |
PMID:17604727
"A mammalian microRNA expression atlas based on small RNA library sequencing"
Cell. 129:1401-1414(2007).
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2 |
PMID:20215419
"MicroRNA transcriptome in the newborn mouse ovaries determined by massive parallel sequencing"
Mol Hum Reprod. 16:463-471(2010).
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