Advanced warning: 8th Sept 2010 - the miRBase website should be considered to be at risk of significant downtime due to essential hardware maintenance.

Pristionchus pacificus miRNAs (124 sequences)

ID Accession Chromosome Start End Strand Fetch
ppc-let-7 MI0011149 Ppa_Contig31
 197569
 197679
 +
ppc-lin-4 MI0011136 Ppa_Contig61
 388674
 388782
 +
ppc-mir-1 MI0011127 Ppa_Contig101
 361557
 361660
 -
ppc-mir-2 MI0011226 Ppa_Contig106
 140705
 140812
 +
ppc-mir-9 MI0011248 Ppa_Contig177
 208085
 208189
 -
ppc-mir-37 MI0011135 Ppa_Contig9
 1712643
 1712733
 -
ppc-mir-38 MI0011218 Ppa_Contig89
 123474
 123571
 +
ppc-mir-42a MI0011129 Ppa_Contig112
 331735
 331839
 -
ppc-mir-42b MI0011145 Ppa_Contig89
 123598
 123688
 +
ppc-mir-45 MI0011128 Ppa_Contig112
 331568
 331663
 -
ppc-mir-46 MI0011147 Ppa_Contig7
 1271994
 1272104
 +
ppc-mir-54 MI0011198 Ppa_Contig0
 2088313
 2088432
 +
ppc-mir-55a MI0011220 Ppa_Contig45
 455749
 455868
 +
ppc-mir-55b MI0011199 Ppa_Contig0
 2088476
 2088567
 +
ppc-mir-56 MI0011221 Ppa_Contig45
 455901
 456006
 +
ppc-mir-63a MI0011150 Ppa_Contig31
 608794
 608913
 -
ppc-mir-63b MI0011138 Ppa_Contig21
 1203087
 1203203
 +
ppc-mir-63c-1 MI0011139 Ppa_Contig21
 1203247
 1203349
 +
ppc-mir-63c-2 MI0011140 Ppa_Contig21
 1203389
 1203504
 +
ppc-mir-63c-3 MI0011141 Ppa_Contig21
 1203538
 1203653
 +
ppc-mir-63c-4 MI0011142 Ppa_Contig21
 1203687
 1203802
 +
ppc-mir-63d MI0011152 Ppa_Contig28
 883870
 883971
 -
ppc-mir-63e MI0011170 Ppa_Contig28
 883010
 883110
 -
ppc-mir-63f MI0011157 Ppa_Contig21
 1203841
 1203942
 +
ppc-mir-63g MI0011130 Ppa_Contig28
 884551
 884645
 -
ppc-mir-63h MI0011171 Ppa_Contig28
 884077
 884185
 -
ppc-mir-65 MI0011158 Ppa_Contig31
 851175
 851271
 +
ppc-mir-67 MI0011216 Ppa_Contig39
 314720
 314825
 +
ppc-mir-71 MI0011151 Ppa_Contig64
 1002722
 1002834
 -
ppc-mir-72 MI0011154 Ppa_Contig40
 365199
 365307
 -
ppc-mir-79 MI0011143 Ppa_Contig177
 113142
 113237
 +
ppc-mir-81 MI0011148 Ppa_Contig41
 615068
 615153
 -
ppc-mir-84a MI0011159 Ppa_Contig84
 219423
 219538
 +
ppc-mir-84b MI0011144 Ppa_Contig84
 219701
 219803
 +
ppc-mir-86 MI0011155 Ppa_Contig46
 799889
 799993
 -
ppc-mir-87 MI0011132 Ppa_Contig87
 188151
 188248
 -
ppc-mir-124 MI0011133 Ppa_Contig144
 517932
 518033
 -
ppc-mir-232 MI0011202 Ppa_Contig319
 9757
 9854
 +
ppc-mir-234 MI0011197 Ppa_Contig9
 495761
 495876
 -
ppc-mir-236 MI0011165 Ppa_Contig65
 75168
 75282
 -
ppc-mir-239-1 MI0011134 Ppa_Contig157
 207151
 207256
 -
ppc-mir-239-2 MI0011146 Ppa_Contig5
 1004187
 1004301
 +
ppc-mir-240 MI0011228 Ppa_Contig140
 224065
 224181
 -
ppc-mir-242 MI0011156 Ppa_Contig98
 243790
 243909
 -
ppc-mir-252 MI0011137 Ppa_Contig63
 489002
 489106
 +
ppc-mir-279 MI0011244 Ppa_Contig106
 140551
 140654
 +
ppc-mir-312 MI0011208 Ppa_Contig73
 118231
 118326
 +
ppc-mir-993 MI0011222 Ppa_Contig46
 1204478
 1204597
 +
ppc-mir-2232-1 MI0011131 Ppa_Contig31
 608462
 608561
 -
ppc-mir-2232-2 MI0011153 Ppa_Contig4
 1507748
 1507867
 -
ppc-mir-2233 MI0011242 Ppa_Contig180
 297969
 298067
 +
ppc-mir-2234a MI0011163 Ppa_Contig63
 318772
 318891
 -
ppc-mir-2234b MI0011164 Ppa_Contig63
 318897
 319011
 -
ppc-mir-2235-1 MI0011174 Ppa_Contig184
 56991
 57080
 -
ppc-mir-2235-2 MI0011175 Ppa_Contig184
 57215
 57304
 -
ppc-mir-2235-3 MI0011176 Ppa_Contig184
 57439
 57528
 -
ppc-mir-2235-4 MI0011177 Ppa_Contig184
 57663
 57752
 -
ppc-mir-2235-5 MI0011178 Ppa_Contig184
 57887
 57976
 -
ppc-mir-2235-6 MI0011179 Ppa_Contig184
 58412
 58501
 -
ppc-mir-2235-7 MI0011180 Ppa_Contig184
 58637
 58726
 -
ppc-mir-2235-8 MI0011181 Ppa_Contig184
 58863
 58949
 -
ppc-mir-2236a MI0011183 Ppa_Contig154
 421543
 421634
 -
ppc-mir-2236b MI0011184 Ppa_Contig154
 421712
 421803
 -
ppc-mir-2237a MI0011205 Ppa_Contig2
 1443971
 1444061
 +
ppc-mir-2237b MI0011206 Ppa_Contig2
 1444727
 1444818
 +
ppc-mir-2237c MI0011233 Ppa_Contig2
 1444093
 1444183
 +
ppc-mir-2238a-1 MI0011193 Ppa_Contig6
 719178
 719295
 -
ppc-mir-2238a-2 MI0011194 Ppa_Contig6
 1210593
 1210703
 -
ppc-mir-2238a-3 MI0011195 Ppa_Contig6
 1507482
 1507578
 -
ppc-mir-2238a-4 MI0011224 Ppa_Contig6
 1027818
 1027937
 +
ppc-mir-2238b-1 MI0011182 Ppa_Contig39
 729859
 729970
 -
ppc-mir-2238b-2 MI0011217 Ppa_Contig39
 506080
 506170
 +
ppc-mir-2238c MI0011196 Ppa_Contig6
 1864856
 1864961
 -
ppc-mir-2238d MI0011213 Ppa_Contig129
 131258
 131359
 +
ppc-mir-2238e MI0011223 Ppa_Contig6
 915545
 915641
 +
ppc-mir-2239-1 MI0011232 Ppa_Contig13
 928461
 928576
 -
ppc-mir-2239-2 MI0011245 Ppa_Contig1757
 890
 1005
 +
ppc-mir-2240a-1 MI0011190 Ppa_Contig6
 626376
 626472
 -
ppc-mir-2240a-2 MI0011191 Ppa_Contig6
 626503
 626599
 -
ppc-mir-2240b MI0011189 Ppa_Contig6
 626254
 626343
 -
ppc-mir-2240c MI0011192 Ppa_Contig6
 626622
 626736
 -
ppc-mir-2241a-1 MI0011246 Ppa_Contig51
 325988
 326075
 -
ppc-mir-2241a-2 MI0011247 Ppa_Contig25
 40539
 40626
 +
ppc-mir-2241a-3 MI0011236 Ppa_Contig25
 39974
 40091
 +
ppc-mir-2241a-4 MI0011238 Ppa_Contig25
 40258
 40354
 +
ppc-mir-2241a-5 MI0011240 Ppa_Contig51
 326119
 326206
 -
ppc-mir-2241b-1 MI0011250 Ppa_Contig25
 40120
 40216
 +
ppc-mir-2241b-2 MI0011237 Ppa_Contig51
 326529
 326625
 -
ppc-mir-2241b-3 MI0011239 Ppa_Contig25
 40396
 40492
 +
ppc-mir-2241c MI0011249 Ppa_Contig51
 326391
 326487
 -
ppc-mir-2242-1 MI0011210 Ppa_Contig76
 643510
 643627
 +
ppc-mir-2242-2 MI0011211 Ppa_Contig76
 643780
 643897
 +
ppc-mir-2243 MI0011209 Ppa_Contig25
 354133
 354228
 +
ppc-mir-2244 MI0011166 Ppa_Contig66
 112056
 112136
 -
ppc-mir-2245 MI0011212 Ppa_Contig27
 40280
 40388
 +
ppc-mir-2246 MI0011214 Ppa_Contig31
 850994
 851093
 +
ppc-mir-2247 MI0011243 Ppa_Contig0
 2933733
 2933825
 -
ppc-mir-2248 MI0011167 Ppa_Contig17
 167868
 167974
 -
ppc-mir-2249 MI0011215 Ppa_Contig286
 18435
 18505
 +
ppc-mir-2250 MI0011219 Ppa_Contig44
 128425
 128529
 +
ppc-mir-2251 MI0011225 Ppa_Contig6
 1815940
 1816039
 +
ppc-mir-2252 MI0011160 Ppa_Contig10
 574680
 574759
 -
ppc-mir-2253 MI0011168 Ppa_Contig26
 807060
 807123
 -
ppc-mir-2254 MI0011169 Ppa_Contig27
 814426
 814514
 -
ppc-mir-2255 MI0011172 Ppa_Contig103
 305549
 305634
 -
ppc-mir-2256 MI0011173 Ppa_Contig103
 350655
 350768
 -
ppc-mir-2257 MI0011161 Ppa_Contig11
 438196
 438308
 -
ppc-mir-2258 MI0011162 Ppa_Contig11
 1411707
 1411817
 -
ppc-mir-2259 MI0011185 Ppa_Contig41
 860240
 860359
 -
ppc-mir-2260 MI0011186
ppc-mir-2261 MI0011187 Ppa_Contig48
 224157
 224237
 -
ppc-mir-2262 MI0011188 Ppa_Contig5
 1065458
 1065570
 -
ppc-mir-2263 MI0011200 Ppa_Contig0
 2092943
 2093034
 +
ppc-mir-2264 MI0011201 Ppa_Contig63
 301580
 301681
 +
ppc-mir-2265 MI0011203 Ppa_Contig2
 1443721
 1443810
 +
ppc-mir-2266 MI0011204 Ppa_Contig2
 1443819
 1443918
 +
ppc-mir-2267 MI0011207 Ppa_Contig21
 468379
 468493
 +
ppc-mir-2268 MI0011227 Ppa_Contig4
 1507377
 1507476
 -
ppc-mir-2269 MI0011229 Ppa_Contig45
 395912
 395987
 -
ppc-mir-2270 MI0011230 Ppa_Contig55
 699394
 699500
 -
ppc-mir-2271 MI0011231 Ppa_Contig0
 2088561
 2088670
 +
ppc-mir-2272 MI0011234 Ppa_Contig21
 467633
 467750
 +
ppc-mir-2273 MI0011235 Ppa_Contig21
 467940
 468038
 +
ppc-mir-2274 MI0011241 Ppa_Contig180
 297842
 297935
 +
Get selected sequences:
Select sequences and output type, then click "Fetch Sequences":