miRBase
Home
Search
Browse
Help
Download
Blog
Submit
Oryzias latipes miRNAs (168 sequences)
ID
Accession
RPM
Chromosome
Start
End
Strand
Fetch
ola-let-7a-1
MI0019430
-
6
6146863
6146961
+
ola-let-7a-2
MI0019444
-
7
13614181
13614265
+
ola-let-7a-3
MI0019551
-
23
6186600
6186694
-
ola-let-7a-4
MI0019508
-
14
15650352
15650450
-
ola-let-7b-1
MI0019431
-
6
6147325
6147415
+
ola-let-7b-2
MI0019550
-
23
6185677
6185764
-
ola-let-7c
MI0019504
-
14
1150882
1150977
-
ola-let-7e
MI0019443
-
7
13613915
13613999
+
ola-let-7g
MI0019441
-
7
11992087
11992180
+
ola-mir-1-1
MI0019437
-
7
5261661
5261761
+
ola-mir-1-2
MI0019525
-
17
29410125
29410225
-
ola-mir-7
MI0019520
-
17
23201267
23201373
+
ola-mir-9a-1
MI0019515
-
16
23834590
23834697
+
ola-mir-9a-2
MI0019421
-
3
20705983
20706084
-
ola-mir-9a-3
MI0019433
-
6
17135424
17135527
+
ola-mir-9a-4
MI0019469
-
9
14619699
14619802
-
ola-mir-9a-5
MI0019557
-
scaffold7831
774
875
+
ola-mir-9b-1
MI0019427
-
4
2428407
2428513
-
ola-mir-9b-2
MI0019522
-
17
23411155
23411254
-
ola-mir-10b
MI0019535
-
21
24625727
24625834
+
ola-mir-10d
MI0019513
-
15
4353705
4353809
-
ola-mir-15a
MI0019534
-
21
11191711
11191814
+
ola-mir-16
MI0019491
-
13
12901172
12901274
+
ola-mir-17
MI0019542
-
21
25694055
25694151
-
ola-mir-18-1
MI0019417
-
3
15107452
15107557
+
ola-mir-18-2
MI0019541
-
21
25693655
25693746
-
ola-mir-19a
MI0019540
-
21
25693520
25693627
-
ola-mir-19b-1
MI0019538
-
21
25693239
25693340
-
ola-mir-19b-2
MI0019476
-
10
23325051
23325153
-
ola-mir-19d
MI0019474
-
10
2001485
2001577
+
ola-mir-20a-1
MI0019418
-
3
15107783
15107891
+
ola-mir-20a-2
MI0019539
-
21
25693363
25693464
-
ola-mir-21-1
MI0019497
-
13
24451854
24451948
-
ola-mir-21-2
MI0019502
-
14
22568052
22568138
+
ola-mir-22-1
MI0019496
-
13
16589470
16589563
-
ola-mir-22-2
MI0019506
-
14
8560446
8560539
-
ola-mir-23a-1
MI0019462
-
8
13688406
13688502
-
ola-mir-23a-2
MI0019528
-
17
29781101
29781198
-
ola-mir-23b
MI0019468
-
9
8313668
8313776
-
ola-mir-24a-1
MI0019426
-
4
34612920
34613020
+
ola-mir-24a-2
MI0019460
-
8
13687323
13687411
-
ola-mir-24a-3
MI0019467
-
9
8309654
8309755
-
ola-mir-24b
MI0019526
-
17
29776748
29776854
-
ola-mir-24c
MI0019464
-
9
7539271
7539366
+
ola-mir-26-1
MI0019454
-
7
26163773
26163870
-
ola-mir-26-2
MI0019521
-
17
17792213
17792312
-
ola-mir-26-3
MI0019532
-
20
16297176
16297277
+
ola-mir-27a
MI0019527
-
17
29779201
29779293
-
ola-mir-27b
MI0019425
-
4
34610548
34610648
+
ola-mir-27c
MI0019461
-
8
13688175
13688281
-
ola-mir-27d
MI0019529
-
17
31554033
31554120
-
ola-mir-29a
MI0019447
-
7
23588631
23588722
+
ola-mir-29b-1
MI0019446
-
7
23588373
23588474
+
ola-mir-29b-2
MI0019545
-
23
8740355
8740453
+
ola-mir-29c
MI0019546
-
23
8740492
8740593
+
ola-mir-30a
MI0019559
-
ultracontig66
99987
100090
+
ola-mir-30c
MI0019480
-
11
21880471
21880580
+
ola-mir-30d
MI0019481
-
11
24547813
24547917
+
ola-mir-30e
MI0019479
-
11
21880298
21880403
+
ola-mir-31
MI0019530
-
18
10684065
10684172
-
ola-mir-33
MI0019456
-
8
12694467
12694560
+
ola-mir-92a-1
MI0019537
-
21
25693131
25693234
-
ola-mir-92a-2
MI0019419
-
3
15108084
15108186
+
ola-mir-92b
MI0019516
-
16
29384732
29384833
+
ola-mir-99
MI0019505
-
14
1151199
1151302
-
ola-mir-100-1
MI0019492
-
13
19564760
19564859
+
ola-mir-100-2
MI0019509
-
14
15650826
15650927
-
ola-mir-101a
MI0019424
-
4
16768335
16768442
+
ola-mir-101b
MI0019486
-
12
15502016
15502123
+
ola-mir-103-1
MI0019475
-
10
2552790
2552891
+
ola-mir-103-2
MI0019544
-
22
25839317
25839417
-
ola-mir-106a
MI0019473
-
10
2001187
2001293
+
ola-mir-107
MI0019512
-
15
14626163
14626269
+
ola-mir-122
MI0019484
-
12
9243561
9243670
+
ola-mir-124-1
MI0019450
-
7
16234646
16234749
-
ola-mir-124-2
MI0019452
-
7
22012171
22012274
-
ola-mir-124-3
MI0019533
-
20
15452264
15452354
-
ola-mir-125a
MI0019517
-
16
11685123
11685209
-
ola-mir-125b-1
MI0019507
-
14
15646480
15646580
-
ola-mir-125b-2
MI0019503
-
14
1144184
1144291
-
ola-mir-125c
MI0019493
-
13
19575653
19575759
+
ola-mir-126
MI0019483
-
12
5052105
5052208
+
ola-mir-128
MI0019482
-
11
21614207
21614306
-
ola-mir-130c
MI0019490
-
12
14200032
14200135
-
ola-mir-132
MI0019495
-
13
10157836
10157934
-
ola-mir-133-1
MI0019524
-
17
29407313
29407419
-
ola-mir-133-2
MI0019438
-
7
5284126
5284231
+
ola-mir-133-3
MI0019553
-
24
13641851
13641950
+
ola-mir-135a-1
MI0019428
-
5
24516531
24516635
-
ola-mir-135a-2
MI0019451
-
7
20955695
20955792
-
ola-mir-135b
MI0019547
-
23
13494412
13494501
+
ola-mir-137
MI0019457
-
8
22468612
22468707
+
ola-mir-138
MI0019435
-
6
23333297
23333392
+
ola-mir-139
MI0019494
-
13
21690229
21690327
+
ola-mir-140
MI0019434
-
6
22770458
22770552
+
ola-mir-142
MI0019511
-
14
21087850
21087953
-
ola-mir-143
MI0019561
-
ultracontig115
5319909
5320017
+
ola-mir-144
MI0019501
-
14
21443523
21443630
+
ola-mir-145
MI0019562
-
ultracontig115
5320131
5320190
+
ola-mir-146a
MI0019514
-
15
22802269
22802374
-
ola-mir-148
MI0019536
-
21
24768738
24768838
+
ola-mir-150
MI0019463
-
8
25382196
25382304
-
ola-mir-152
MI0019458
-
8
24625017
24625117
+
ola-mir-181a-1
MI0019465
-
9
27956541
27956646
+
ola-mir-181a-2
MI0019560
-
ultracontig105
3834
3903
+
ola-mir-181b-1
MI0019423
-
4
12358479
12358573
+
ola-mir-181b-2
MI0019466
-
9
27956674
27956783
+
ola-mir-182
MI0019549
-
23
14604891
14604991
+
ola-mir-183-1
MI0019436
-
6
16407646
16407754
-
ola-mir-183-2
MI0019548
-
23
14604483
14604573
+
ola-mir-184-1
MI0019420
-
3
25857484
25857579
+
ola-mir-184-2
MI0019432
-
6
12810246
12810343
+
ola-mir-187
MI0019478
-
11
7840464
7840550
+
ola-mir-190b
MI0019556
-
scaffold3772
6997
7097
+
ola-mir-192
MI0019500
-
14
20215822
20215919
+
ola-mir-193a
MI0019413
-
1
11805716
11805813
+
ola-mir-194
MI0019499
-
14
20215672
20215781
+
ola-mir-196a
MI0019442
-
7
12869858
12869962
+
ola-mir-199a-1
MI0019422
-
4
4302500
4302597
+
ola-mir-199a-2
MI0019455
-
8
9465167
9465270
+
ola-mir-199a-3
MI0019485
-
12
11677445
11677547
+
ola-mir-199a-4
MI0019518
-
17
16117948
16118038
+
ola-mir-200a
MI0019448
-
7
217696
217792
-
ola-mir-200b
MI0019449
-
7
217985
218082
-
ola-mir-203
MI0019543
-
22
12363247
12363355
-
ola-mir-204
MI0019470
-
9
16361098
16361193
-
ola-mir-205
MI0019453
-
7
22980041
22980147
-
ola-mir-206
MI0019552
-
24
13641157
13641256
+
ola-mir-210
MI0019554
-
scaffold676
57142
57246
+
ola-mir-214
MI0019519
-
17
16119235
16119335
+
ola-mir-218a-1
MI0019414
-
1
17054065
17054169
-
ola-mir-218a-2
MI0019472
-
10
1526115
1526205
+
ola-mir-218b
MI0019488
-
12
14121562
14121651
-
ola-mir-221
MI0019415
-
2
28254368
28254470
-
ola-mir-222
MI0019416
-
2
28254507
28254612
-
ola-mir-223
MI0019510
-
14
17328705
17328803
-
ola-mir-301a
MI0019498
-
14
13145539
13145637
+
ola-mir-301b
MI0019489
-
12
14199739
14199843
-
ola-mir-338-1
MI0019459
-
8
10136028
10136119
-
ola-mir-338-2
MI0019531
-
19
2103870
2103971
-
ola-mir-338-3
MI0019563
-
ultracontig221
99754
99854
-
ola-mir-430a-1
MI0013008
-
4
6743
6824
+
ola-mir-430a-2
MI0013014
-
4
2064352
2064433
+
ola-mir-430a-3
MI0013017
-
4
2065212
2065293
+
ola-mir-430a-4
MI0013018
-
4
2068492
2068573
+
ola-mir-430b-1
MI0013010
-
4
7977
8058
+
ola-mir-430b-2
MI0013021
-
ola-mir-430c-1
MI0013009
-
4
6962
7047
+
ola-mir-430c-2
MI0013011
-
4
scaffold4154
8194
315
8281
402
+
-
ola-mir-430c-3
MI0013012
-
4
13010
13098
+
ola-mir-430c-4
MI0013015
-
ola-mir-430c-5
MI0013019
-
4
2068709
2068796
+
ola-mir-430c-6
MI0013022
-
ola-mir-430c-7
MI0013023
-
ola-mir-430d-1
MI0013013
-
4
2061569
2061655
-
ola-mir-430d-2
MI0013016
-
4
2064788
2064874
+
ola-mir-430d-3
MI0013020
-
4
2069008
2069094
+
ola-mir-455
MI0019487
-
12
7386668
7386750
-
ola-mir-458
MI0019477
-
10
25327849
25327943
-
ola-mir-459
MI0019558
-
ultracontig26
364478
364582
+
ola-mir-460
MI0019523
-
17
29024041
29024125
-
ola-mir-462
MI0019439
-
7
6519353
6519420
+
ola-mir-499
MI0019429
-
5
26842783
26842879
-
ola-mir-729
MI0019555
-
scaffold1021
47304
47403
+
ola-mir-731
MI0019440
-
7
6519816
6519913
+
ola-mir-1306
MI0019471
-
9
23130448
23130557
-
ola-mir-1388
MI0019445
-
7
15988885
15988992
+
ola-mir-1788
MI0019564
-
ultracontig257
1240225
1240320
-
Get selected sequences:
Stem-loop sequence
Mature sequence
Select sequences and output type, then click "Fetch Sequences":
Unaligned fasta format
ClustalW alignment