Stem-loop sequence hsa-mir-4796

Accession

MI0017443

Description

Homo sapiens miR-4796 stem-loop

Gene family

MIPF0001402; mir-4796

Stem-loop

                               --uu    c 
uaaauuugugucuauacucugucacuuuacu    uggc u
|||||||||||||||||||||||||||||||    |||| c
auuuaaacacagauaugagacggugaaauga    acug a
                               cguu    a 

Genome context

• Coordinates (GRCh37.p5): chr3: 114462292-114462372 [-]
• Overlapping transcripts:

  sense

  OTTHUMT00000354950 ; ZBTB20-002; intron 1

  OTTHUMT00000354952 ; ZBTB20-004; intron 1

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  ENST00000471418 ; ZBTB20-004; intron 1

  ENST00000464560 ; ZBTB20-002; intron 1

  ENST00000471418 ; ZBTB20-004; intron 1

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  ENST00000462705 ; ZBTB20-006; intron 5

  ENST00000463890 ; ZBTB20-013; intron 5

Database links

• ENTREZGENE: 100616166;MIR4796

Mature sequence hsa-miR-4796-5p

• Accession: MIMAT0019970
• Sequence: 9 - ugucuauacucugucacuuuac - 30
• Evidence: experimental; Solexa [1]
• Predicted targets:
  • DIANA-MICROT:hsa-miR-4796-5p
  • MIRDB:hsa-miR-4796-5p
  • TARGETMINER:hsa-miR-4796-5p

Mature sequence hsa-miR-4796-3p

• Accession: MIMAT0019971
• Sequence: 53 - uaaaguggcagaguauagacac - 74
• Evidence: experimental; Solexa [1]
• Predicted targets:
  • DIANA-MICROT:hsa-miR-4796-3p
  • MIRDB:hsa-miR-4796-3p
  • TARGETMINER:hsa-miR-4796-3p

References

1. PMID:21199797 "Identification of new microRNAs in paired normal and tumor breast tissue suggests a dual role for the ERBB2/Her2 gene" Persson H, Kvist A, Rego N, Staaf J, Vallon-Christersson J, Luts L, Loman N, Jonsson G, Naya H, Hoglund M, Borg A, Rovira C Cancer Res. 71:78-86(2011).