Stem-loop sequence hsa-mir-548v

Accession MI0014174
Description Homo sapiens miR-548v stem-loop
Gene family MIPF0000317; mir-548
Stem-loop 
    c      u a             cg     --  ca 
aaua uagguu g gcaaaaguaauug  guuuu  gc  u
|||| |||||| | |||||||||||||  |||||  ||   
uuau auccga c cguuuucauugac  cgaaa  cg  c
    a      c a             au     ac  ua
Get sequence
Deep sequencing
41 reads, 13 experiments
Genome context
Coordinates (GRCh37.p5) Overlapping transcripts
chr8: 17539087-17539166 [-]
sense
OTTHUMT00000375244 ; MTUS1-005; intron 2
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OTTHUMT00000375248 ; MTUS1-004; intron 5
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OTTHUMT00000375245 ; MTUS1-002; intron 7
OTTHUMT00000375247 ; MTUS1-001; intron 7
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ENST00000381869 ; MTUS1-202; intron 6
ENST00000381869 ; MTUS1-202; intron 6
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ENST00000520196 ; MTUS1-002; intron 7
ENST00000262102 ; MTUS1-001; intron 7
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ENST00000520196 ; MTUS1-002; intron 7
ENST00000262102 ; MTUS1-001; intron 7
Database links

Mature sequence hsa-miR-548v

Accession MIMAT0015020
Sequence

49 -  

agcuacaguuacuuuugcacca

 - 70

Get sequence
Deep sequencing 24 reads, 8 experiments
Evidence experimental; Solexa [1]
Predicted targets

References

1
PMID:20300190 "Characterization of the Melanoma miRNAome by Deep Sequencing" Stark MS, Tyagi S, Nancarrow DJ, Boyle GM, Cook AL, Whiteman DC, Parsons PG, Schmidt C, Sturm RA, Hayward NK PLoS One. 5:e9685(2010).